MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p666

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017722	TGC	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017722	CAG	2	6	75	80	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017722	CA	3	6	82	87	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017722	ACTG	2	8	142	149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017722	T	8	8	161	168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017722	CAGA	2	8	195	202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017722	TAC	2	6	283	288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017722	GA	3	6	481	486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017722	CGA	2	6	513	518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017722	CCAG	2	8	595	602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017722	ATG	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017722	ACA	2	6	632	637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017722	GCG	3	9	680	688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017722	GAGG	2	8	701	708	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017722	TGG	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017722	CGC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017722	TCTG	2	8	822	829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017722	AATG	2	8	865	872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017722	AGT	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017722	GGC	2	6	937	942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017722	A	6	6	1042	1047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017722	GTT	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017722	T	6	6	1089	1094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017722	T	7	7	1108	1114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017722	ATT	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017722	GAG	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017722	TTG	2	6	2134	2139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017722	GAA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017722	GCCA	2	8	2269	2276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017722	CCT	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017722	TAC	2	6	2644	2649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017722	T	6	6	2652	2657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017722	TAAT	2	8	3449	3456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017722	ATGA	2	8	3700	3707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017722	GCA	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017722	CA	3	6	4243	4248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017722	A	6	6	4309	4314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017722	A	7	7	4362	4368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017722	TAT	2	6	4646	4651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017722	ATA	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017722	AAT	2	6	4664	4669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017722	T	6	6	4692	4697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017722	TAA	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017722	ACC	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017722	AGA	2	6	4780	4785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017722	TGC	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017722	AC	3	6	4809	4814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017722	TAT	2	6	4850	4855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017722	ACAG	2	8	4878	4885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017722	ATA	2	6	4906	4911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017722	ATC	2	6	4915	4920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017722	CCGCAA	2	12	4950	4961	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017722	A	6	6	5713	5718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017722	TATTT	2	10	5719	5728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017722	AAAG	2	8	5746	5753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017722	ACG	2	6	5786	5791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017722	ATCA	2	8	5806	5813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017722	AAT	2	6	5843	5848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017722	AATG	2	8	5857	5864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017722	TAC	2	6	5876	5881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017722	A	6	6	5894	5899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017722	CTC	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017722	TAT	2	6	6202	6207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017722	AAT	2	6	6215	6220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017722	CCT	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017722	CT	3	6	6285	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017722	ATC	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017722	GAT	2	6	15284	15289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017722	GGT	2	6	15334	15339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017722	GTCA	2	8	15386	15393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017722	TGA	2	6	15529	15534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017722	TGA	2	6	15591	15596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017722	GAT	2	6	15650	15655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017722	AC	4	8	15706	15713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017722	ACA	2	6	15718	15723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017722	GA	3	6	15818	15823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017722	ATG	2	6	18460	18465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017722	ATT	2	6	18469	18474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017722	GGA	2	6	18486	18491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017722	CAGAC	2	10	18494	18503	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017722	A	6	6	18548	18553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017722	AT	3	6	18579	18584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017722	GTG	2	6	18669	18674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017722	CCA	2	6	18676	18681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017722	AGT	2	6	18686	18691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017722	TGC	2	6	21047	21052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017722	TCAG	2	8	21104	21111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017722	GAC	2	6	21135	21140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017722	TAA	2	6	21173	21178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017722	CAG	2	6	21206	21211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017722	GCTCAT	2	12	21342	21353	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017722	T	6	6	21369	21374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017722	TCC	2	6	21615	21620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017722	CCG	2	6	21703	21708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017722	TCT	2	6	27253	27258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017722	AAT	2	6	27280	27285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017722	TTA	2	6	27318	27323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017722	CCT	2	6	28027	28032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017722	GTC	2	6	28069	28074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017722	TTTCAA	2	12	28091	28102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017722	TAAT	2	8	28126	28133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017722	T	6	6	28603	28608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017722	ATAAA	2	10	28613	28622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017722	ATA	2	6	28647	28652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017722	AGC	2	6	28672	28677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017722	A	7	7	28697	28703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017722	CGC	2	6	28711	28716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017722	AGC	2	6	28718	28723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017722	ATG	2	6	28738	28743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017722	T	7	7	28744	28750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017722	ACC	2	6	28766	28771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017722	GTT	2	6	28793	28798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017722	T	6	6	28818	28823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017722	AG	3	6	28835	28840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017722	GT	3	6	28909	28914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017722	TGG	2	6	28923	28928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017722	ACC	2	6	28934	28939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017722	ATT	2	6	28972	28977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017722	CA	4	8	29568	29575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017722	TA	4	8	29636	29643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017722	CCT	2	6	29660	29665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017722	TGA	2	6	29717	29722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017722	GAC	2	6	29738	29743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017722	GAT	2	6	29759	29764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017722	TAA	2	6	30664	30669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017722	T	6	6	30673	30678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017722	ATC	2	6	30687	30692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017722	C	6	6	30692	30697	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_017722	ACA	2	6	30719	30724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017722	TCC	2	6	31044	31049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017722	CAT	2	6	31072	31077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017722	CGC	2	6	31169	31174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017722	T	6	6	31227	31232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017722	A	6	6	31247	31252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017722	CAGT	2	8	31280	31287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017722	ACA	2	6	31352	31357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017722	CGC	2	6	31371	31376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017722	ACG	2	6	31378	31383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017722	CGG	2	6	31423	31428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017722	GGC	2	6	31472	31477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017722	GCCC	2	8	31570	31577	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_017722	AAC	2	6	31614	31619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017722	AAT	2	6	31629	31634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017722	GCA	2	6	31639	31644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017722	AGG	2	6	31662	31667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017722	AAT	2	6	31676	31681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017722	GTGAT	2	10	31692	31701	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017722	GC	3	6	31753	31758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017722	GTT	2	6	31803	31808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017722	CAG	2	6	31854	31859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017722	AGT	2	6	31880	31885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017722	CA	3	6	32211	32216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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158	NC_017722	GGC	2	6	33825	33830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_017722	TCG	3	9	34981	34989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_017722	ACC	2	6	47175	47180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_017722	ATG	2	6	47213	47218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017722	T	6	6	47250	47255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017722	ATA	2	6	47270	47275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017722	AT	3	6	47280	47285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017722	ACA	2	6	47292	47297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_017722	AAC	2	6	47363	47368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_017722	A	6	6	47407	47412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017722	GTT	2	6	47446	47451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_017722	TTCA	2	8	47576	47583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
299	NC_017722	T	6	6	47602	47607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_017722	TGT	2	6	47657	47662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_017722	GCA	2	6	47794	47799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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305	NC_017722	CTT	2	6	47920	47925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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313	NC_017722	TG	3	6	50059	50064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
314	NC_017722	GCA	2	6	50147	50152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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327	NC_017722	TGCC	2	8	52166	52173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
328	NC_017722	A	6	6	52184	52189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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338	NC_017722	ATTG	2	8	52568	52575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_017722	GTT	2	6	64472	64477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_017722	AGA	3	9	66150	66158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_017722	TA	3	6	66305	66310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017722	ACGT	2	8	66330	66337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
429	NC_017722	CAT	2	6	66669	66674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.